Ο Μανώλης Κουτουλάκης υπηρετεί ως Γενικός Γραμματέας του Υπουργείου Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής, αρμόδιος για το Αιγαίο και τη Νησιωτική Πολιτική. Είναι διπλωματούχος Μηχανικός Χωροταξίας, Πολεοδομίας και Περιφερειακής Ανάπτυξης και κατέχει Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης στη Χωροταξία και Περιφερειακή Πολιτική. Είναι υποψήφιος Διδάκτωρ στις Διεθνείς και Ευρωπαϊκές Σχέσεις στο Πανεπιστήμιο Πειραιώς, με εξειδίκευση στην έρευνα και ανάλυση των χωρικών και οικονομικών επιπτώσεων επιλεγμένων ευρωπαϊκών πολιτικών στην Ελλάδα.

Έχει διατελέσει Ειδικός Σύμβουλος στο Υπουργείο Ανάπτυξης και Ανταγωνιστικότητας (2010-2012), σε θέματα που αφορούσαν στην αξιολόγηση Δημόσιων και Ιδιωτικών Επενδύσεων, την προετοιμασία ειδικών χρηματοδοτικών εργαλείων για την επιχειρηματικότητα και την παρακολούθηση της υλοποίησης του Προγράμματος Δημοσίων Επενδύσεων.

Κατά την περίοδο 2014-2015 υπήρξε Ειδικός Σύμβουλος στο Υπουργείο Εργασίας, Κοινωνικής Ασφάλισης και Πρόνοιας, στον τομέα της ανάλυσης πολιτικής και του σχεδιασμού Προγραμμάτων Κοινωνικής Οικονομίας, του σχεδιασμού συγκεκριμένων μέτρων για την προώθηση της απασχόλησης, καθώς και της διαμόρφωσης τομεακής χρηματοδοτικής πολιτικής για τη Διά Βίου Μάθηση και το Σχέδιο Δράσης για την Εγγύηση Νεολαίας.

Έχει συμμετάσχει ως εμπειρογνώμονας σε Διεθνείς και Ευρωπαϊκούς Οργανισμούς σε έργα μεταρρύθμισης του δημόσιου τομέα, με έμφαση στην Τοπική Ανάπτυξη και τη Δημόσια Διοίκηση. Επίσης, έχει συμμετάσχει ή συντονίσει την υλοποίηση πολυάριθμων μελετών και προγραμμάτων ανάπτυξης για Δήμους και Περιφέρειες και έχει αποκτήσει εξειδίκευση στη διαχείριση ευρωπαϊκής χρηματοδότησης, στον στρατηγικό και επιχειρησιακό σχεδιασμό δημόσιων φορέων για τη γαλάζια ανάπτυξη, τη νησιωτικότητα και την τοπική εφαρμογή της πολιτικής συνοχής της ΕΕ.

Διετέλεσε επικεφαλής του Γραφείου Διασύνδεσης και Καινοτομίας στο Πανεπιστήμιο Πειραιώς (2017-2019) και συντονιστής του Ευρωπαϊκού Κέντρου Πληροφόρησης της Πρωτοβουλίας της Ευρωπαϊκής Επιτροπής “Europe Direct” για τον Πειραιά και τα Νησιά της Αττικής.

Από τον Ιούλιο του 2019 έως τον Απρίλιο του 2021 υπηρέτησε ως Ειδικός Σύμβουλος του Υπουργού Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής για τη διαχείριση των Ευρωπαϊκών Πολιτικών στους τομείς της ναυτιλίας, των θαλάσσιων μεταφορών, της θαλάσσιας ασφάλειας και επιτήρησης, καθώς και της γαλάζιας οικονομίας, της νησιωτικότητας και του ψηφιακού μετασχηματισμού του Υπουργείου. Ήταν επικεφαλής της ομάδας σύνταξης και τελικής παρουσίασης του νέου νομικού πλαισίου για την Ολοκληρωμένη Θαλάσσια Πολιτική στον Νησιωτικό Χώρο (Νόμος 4832/2021).

Κατά τη θητεία του ως Γενικός Γραμματέας Αιγαίου και Νησιωτικής Πολιτικής, ασχολείται με κρίσιμα ζητήματα όπως η ολιστική διαχείριση των υδατικών πόρων, η προώθηση της ευρωπαϊκής διάστασης της νησιωτικότητας σε συνεργασία με ευρωπαίους εταίρους, η προστασία του δομημένου περιβάλλοντος, η βελτίωση της συνδεσιμότητας των νησιών, η ενίσχυση της κοινωνικής συνοχής και της πολιτιστικής ταυτότητας των νησιών, κ.ά.